中科院動(dòng)物研究所目前有四個(gè)研究部門，分別是動(dòng)物進(jìn)化與系統(tǒng)學(xué)研究組、動(dòng)物生態(tài)與保護(hù)研究組、動(dòng)物分子生物學(xué)研究組和動(dòng)物行為與認(rèn)知研究組。

這些研究組主要從不同角度研究動(dòng)物的進(jìn)化、系統(tǒng)學(xué)、生態(tài)、保護(hù)、分子生物學(xué)、行為和認(rèn)知等方面的問題，探討動(dòng)物在自然界中的生存和適應(yīng)策略，為保護(hù)和利用動(dòng)物資源提供科學(xué)依據(jù)。同時(shí)，這些研究組還致力于培養(yǎng)和培訓(xùn)青年科學(xué)家，推動(dòng)動(dòng)物學(xué)科學(xué)的發(fā)展。