基因頻率（gene frequency）是指在一個種群基因庫中，某個基因占全部等位基因數(shù)的比率。群體中某一特定基因的頻率可以從基因型頻率（genotype frequency）來推算。

如人們熟悉的人的MN血型，它是由一對共顯性等位基因M和N所決定，產(chǎn)生3種基因型M/M、M/N和N/N，而相應的表型是M、MN和N，而且比例是1/4M、1/2MN和1/4N。

這個原理可以推廣到一般群體內婚配，如以群體中MN表型（基因型）的具體樣本數(shù)被所觀察到總數(shù)相除即可得到（轉換）相對頻率數(shù)。