2002年9月，崇雅中學(xué)高中部異地新建，與初中部分離辦學(xué)。

崇雅新校區(qū)設(shè)有崇雅中學(xué)高中部、崇雅實(shí)驗(yàn)學(xué)校兩所學(xué)校，實(shí)行初、高中一貫制辦學(xué)，現(xiàn)有高中班級74個、高中學(xué)生4800人，初中班級34個、初中學(xué)生1800人。

崇雅中學(xué)2003年底被評為廣東省一級學(xué)校，2006年4月通過國家級示范性高中初期驗(yàn)收，2007年3月通過終評，成為珠三角及粵東地區(qū)第一所國家級示范性高中和省普通高中教學(xué)水平優(yōu)秀學(xué)校。